La fundación de Amapá es el resultado de la negociación entre dos grandes empresarios: Fernández de Otáñez y Fernando Rivadeneyra quienes pugnaban por preservar el funcionamiento de la Ruta del Algodón y la Vainilla que se iniciaba en la Cañada de Cuicatlan, cruzaba los pueblos mazatecos hacia la Estanzuela y continuaba rumbo a Tlalixcoyan hasta alcanzar el puerto veracruzano, o dicho en términos de García de león.
Santa maría Amapá es hoy una agencia municipal del municipio de Tuxtepec, ubicada en la porción noroeste del municipio, a orillas del rio del mismo nombre y cuyo acceso principal se ubica sobre la carretera la granja – temascal.
